Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ08

SPANXN4, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N4, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN4Q5MJ08 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPANXN4Q5MJ08 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPANXN4Q5MJ08 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPANXN4Q5MJ08 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPANXN4Q5MJ08 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPANXN4Q5MJ08 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPANXN4Q5MJ08 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPANXN4Q5MJ08 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms