Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NRF1Q16656 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NRF1Q16656 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NRF1Q16656 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NRF1Q16656 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NRF1Q16656 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NRF1Q16656 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NRF1Q16656 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NRF1Q16656 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NRF1Q16656 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NRF1Q16656 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NRF1Q16656 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NRF1Q16656 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NRF1Q16656 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NRF1Q16656 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NRF1Q16656 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NRF1Q16656 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NRF1Q16656 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NRF1Q16656 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NRF1Q16656 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NRF1Q16656 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NRF1Q16656 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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NRF1Q16656 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NRF1Q16656 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NRF1Q16656 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NRF1Q16656 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NRF1Q16656 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NRF1Q16656 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NRF1Q16656 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NRF1Q16656 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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NRF1Q16656 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NRF1Q16656 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NRF1Q16656 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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NRF1Q16656 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NRF1Q16656 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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NRF1Q16656 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NRF1Q16656 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
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NRF1Q16656 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NRF1Q16656 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NRF1Q16656 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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