Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 NDUFC1-206ENST00000505036 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.234e-11■■□□□ 13.8
PCBP1Q15365 NDUFC1-205ENST00000503997 628 ntTSL 311.63□□□□□ -0.554e-11■■□□□ 13.8
PCBP1Q15365 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.84e-7■■□□□ 13.8
PCBP1Q15365 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.454e-7■■□□□ 13.8
PCBP1Q15365 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.454e-7■■□□□ 13.8
PCBP1Q15365 SLC25A5-201ENST00000317881 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.051e-6■■□□□ 13.8
PCBP1Q15365 SLC25A5-204ENST00000475354 483 ntTSL 512.33□□□□□ -0.441e-6■■□□□ 13.8
PCBP1Q15365 HLA-A-207ENST00000495183 1766 nt26.93■■□□□ 1.94e-31■■□□□ 13.8
PCBP1Q15365 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.724e-31■■□□□ 13.8
PCBP1Q15365 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC19.44■□□□□ 0.74e-31■■□□□ 13.8
PCBP1Q15365 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.64e-31■■□□□ 13.8
PCBP1Q15365 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.88■□□□□ 0.454e-31■■□□□ 13.8
PCBP1Q15365 HLA-A-208ENST00000496081 1786 nt17.61■□□□□ 0.414e-31■■□□□ 13.8
PCBP1Q15365 CYC1-202ENST00000525122 543 ntTSL 214.71□□□□□ -0.051e-6■■□□□ 13.8
PCBP1Q15365 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.221e-6■■□□□ 13.8
PCBP1Q15365 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.073e-7■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.073e-7■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.113e-7■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 HBE1-201ENST00000292896 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.684e-37■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 SPIRE2-209ENST00000566337 1369 ntTSL 525.09■■□□□ 1.614e-10■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 MGAT4B-216ENST00000520969 1096 ntTSL 324.43■■□□□ 1.51e-6■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 MGAT4B-219ENST00000522293 759 ntTSL 314.18□□□□□ -0.141e-6■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 TFR2-203ENST00000461176 692 ntTSL 319.38■□□□□ 0.691e-6■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 PVT1-214ENST00000522875 922 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.121e-8■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 PVT1-211ENST00000521600 408 ntTSL 24.11□□□□□ -1.751e-8■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 PVT1-202ENST00000512617 383 ntTSL 33.94□□□□□ -1.781e-8■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 PVT1-224ENST00000616386 113 nt2.58□□□□□ -21e-8■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 APH1A-201ENST00000236017 663 ntTSL 220.15■□□□□ 0.828e-8■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 SUPT5H-218ENST00000600818 718 ntTSL 215.08■□□□□ 08e-8■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 APH1A-209ENST00000493092 585 ntTSL 314.09□□□□□ -0.158e-8■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 APH1A-205ENST00000461320 1038 ntTSL 313.51□□□□□ -0.258e-8■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 BAG6-262ENST00000470875 1000 ntTSL 524.09■■□□□ 1.455e-7■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 FKBP8-208ENST00000597611 966 ntTSL 316.99■□□□□ 0.312e-15■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 AC118553.2-205ENST00000638779 1983 ntTSL 523.41■■□□□ 1.342e-7■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.752e-7■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.712e-7■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 RNF44-204ENST00000506378 848 ntTSL 219.34■□□□□ 0.693e-25■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.662e-7■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 CDCA5-205ENST00000524733 835 ntTSL 319.02■□□□□ 0.642e-7■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 CDCA5-208ENST00000529290 789 ntTSL 518.93■□□□□ 0.622e-7■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.612e-7■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 AC118553.2-204ENST00000639040 2568 ntTSL 518.85■□□□□ 0.612e-7■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.562e-7■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 UNC13D-206ENST00000586519 403 ntTSL 518.39■□□□□ 0.532e-7■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 RNF44-205ENST00000508478 662 ntTSL 318.12■□□□□ 0.493e-25■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.462e-7■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.362e-7■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 GANAB-214ENST00000534613 737 ntTSL 517.27■□□□□ 0.362e-7■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 GANAB-204ENST00000525994 390 ntTSL 417.18■□□□□ 0.342e-7■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.332e-7■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 CBFA2T3-207ENST00000564416 399 ntTSL 517.06■□□□□ 0.322e-7■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.32e-7■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.142e-7■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.122e-7■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 AC118553.2-201ENST00000638968 3175 ntTSL 515.74■□□□□ 0.112e-7■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.112e-7■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.032e-7■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 Z84485.1-201ENST00000526611 587 ntTSL 314.3□□□□□ -0.122e-7■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 CBFA2T3-209ENST00000569443 469 ntTSL 514.19□□□□□ -0.142e-7■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 AC118553.2-208ENST00000640357 3488 ntTSL 513.8□□□□□ -0.22e-7■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.232e-7■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.242e-7■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.342e-7■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 CDCA5-210ENST00000533015 563 ntTSL 212.82□□□□□ -0.362e-7■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 GANAB-213ENST00000534422 702 ntTSL 512.75□□□□□ -0.372e-7■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.412e-7■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 GPI-213ENST00000590362 378 ntTSL 512.25□□□□□ -0.452e-7■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 GPANK1-208ENST00000458083 802 ntTSL 311.87□□□□□ -0.512e-7■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 TET3-203ENST00000475405 1608 ntTSL 1 (best)11.78□□□□□ -0.522e-7■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 CELF1-203ENST00000361904 1580 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.534e-17■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 GANAB-215ENST00000534779 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.532e-7■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 AC118553.2-206ENST00000639171 5352 ntTSL 511.5□□□□□ -0.572e-7■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 CELF1-204ENST00000395290 7666 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.574e-17■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 CBFA2T3-203ENST00000562719 539 ntTSL 511.46□□□□□ -0.572e-7■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 CDCA5-206ENST00000525464 672 ntTSL 511.07□□□□□ -0.642e-7■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 GPANK1-206ENST00000445768 822 ntTSL 311□□□□□ -0.652e-7■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 CELF1-205ENST00000395292 2191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.894e-17■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 RNF216-201ENST00000389900 3104 ntTSL 1 (best)9.37□□□□□ -0.912e-7■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 CELF1-202ENST00000358597 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.924e-17■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 RNF216-206ENST00000469375 922 ntTSL 39.05□□□□□ -0.962e-7■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 GPANK1-207ENST00000456540 627 ntTSL 38.59□□□□□ -1.032e-7■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 AC118553.2-207ENST00000640238 2901 ntTSL 57.05□□□□□ -1.282e-7■■□□□ 13.7
PCBP1Q15365 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.176e-43■■□□□ 13.6
PCBP1Q15365 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.136e-43■■□□□ 13.6
PCBP1Q15365 CANX-207ENST00000503303 345 ntTSL 58.87□□□□□ -0.996e-43■■□□□ 13.6
PCBP1Q15365 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.371e-7■■□□□ 13.6
PCBP1Q15365 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.128e-7■■□□□ 13.6
PCBP1Q15365 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.028e-7■■□□□ 13.6
PCBP1Q15365 TPM3-223ENST00000611659 3149 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.548e-7■■□□□ 13.6
PCBP1Q15365 TPM3-207ENST00000341372 2007 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.68e-7■■□□□ 13.6
PCBP1Q15365 TPM3-212ENST00000368533 3131 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.648e-7■■□□□ 13.6
PCBP1Q15365 TPM3-213ENST00000368545 2147 ntTSL 1 (best)9.37□□□□□ -0.918e-7■■□□□ 13.6
PCBP1Q15365 TPM3-215ENST00000469717 4041 ntTSL 27.55□□□□□ -1.28e-7■■□□□ 13.6
PCBP1Q15365 ANXA11-208ENST00000463657 780 ntTSL 520.33■□□□□ 0.852e-6■■□□□ 13.6
PCBP1Q15365 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.512e-6■■□□□ 13.6
PCBP1Q15365 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.52e-6■■□□□ 13.6
PCBP1Q15365 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.322e-6■■□□□ 13.6
PCBP1Q15365 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.062e-6■■□□□ 13.6
PCBP1Q15365 PICALM-201ENST00000356360 1958 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -12e-6■■□□□ 13.6
PCBP1Q15365 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.662e-6■■□□□ 13.6
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