Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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