Protein–RNA interactions for Protein: Q01650

SLC7A5, Large neutral amino acids transporter small subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A5Q01650 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC7A5Q01650 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC7A5Q01650 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC7A5Q01650 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC7A5Q01650 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC7A5Q01650 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC7A5Q01650 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC7A5Q01650 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC7A5Q01650 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC7A5Q01650 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC7A5Q01650 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC7A5Q01650 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC7A5Q01650 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC7A5Q01650 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC7A5Q01650 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC7A5Q01650 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC7A5Q01650 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC7A5Q01650 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC7A5Q01650 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC7A5Q01650 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC7A5Q01650 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC7A5Q01650 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC7A5Q01650 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC7A5Q01650 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC7A5Q01650 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC7A5Q01650 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC7A5Q01650 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC7A5Q01650 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC7A5Q01650 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC7A5Q01650 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC7A5Q01650 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC7A5Q01650 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC7A5Q01650 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC7A5Q01650 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC7A5Q01650 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC7A5Q01650 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC7A5Q01650 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC7A5Q01650 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC7A5Q01650 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SLC7A5Q01650 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SLC7A5Q01650 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SLC7A5Q01650 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SLC7A5Q01650 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SLC7A5Q01650 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC7A5Q01650 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC7A5Q01650 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC7A5Q01650 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC7A5Q01650 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC7A5Q01650 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC7A5Q01650 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC7A5Q01650 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC7A5Q01650 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC7A5Q01650 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC7A5Q01650 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC7A5Q01650 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC7A5Q01650 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC7A5Q01650 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC7A5Q01650 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC7A5Q01650 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC7A5Q01650 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC7A5Q01650 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC7A5Q01650 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC7A5Q01650 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC7A5Q01650 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC7A5Q01650 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC7A5Q01650 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC7A5Q01650 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC7A5Q01650 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC7A5Q01650 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC7A5Q01650 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC7A5Q01650 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC7A5Q01650 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC7A5Q01650 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC7A5Q01650 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC7A5Q01650 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC7A5Q01650 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC7A5Q01650 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC7A5Q01650 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC7A5Q01650 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC7A5Q01650 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC7A5Q01650 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC7A5Q01650 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC7A5Q01650 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC7A5Q01650 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC7A5Q01650 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC7A5Q01650 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC7A5Q01650 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC7A5Q01650 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC7A5Q01650 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC7A5Q01650 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC7A5Q01650 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC7A5Q01650 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC7A5Q01650 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC7A5Q01650 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC7A5Q01650 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC7A5Q01650 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC7A5Q01650 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC7A5Q01650 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC7A5Q01650 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC7A5Q01650 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms