Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAX9P55771 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAX9P55771 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAX9P55771 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAX9P55771 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PAX9P55771 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAX9P55771 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PAX9P55771 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAX9P55771 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAX9P55771 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAX9P55771 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAX9P55771 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAX9P55771 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAX9P55771 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAX9P55771 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAX9P55771 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAX9P55771 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PAX9P55771 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAX9P55771 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PAX9P55771 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAX9P55771 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAX9P55771 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAX9P55771 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAX9P55771 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAX9P55771 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAX9P55771 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAX9P55771 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAX9P55771 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAX9P55771 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAX9P55771 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAX9P55771 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAX9P55771 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PAX9P55771 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PAX9P55771 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAX9P55771 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAX9P55771 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAX9P55771 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAX9P55771 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAX9P55771 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAX9P55771 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAX9P55771 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAX9P55771 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAX9P55771 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAX9P55771 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PAX9P55771 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAX9P55771 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PAX9P55771 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAX9P55771 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAX9P55771 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAX9P55771 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAX9P55771 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAX9P55771 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAX9P55771 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAX9P55771 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAX9P55771 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAX9P55771 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAX9P55771 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAX9P55771 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAX9P55771 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAX9P55771 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAX9P55771 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAX9P55771 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAX9P55771 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAX9P55771 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAX9P55771 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAX9P55771 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAX9P55771 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAX9P55771 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAX9P55771 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PAX9P55771 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAX9P55771 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAX9P55771 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAX9P55771 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PAX9P55771 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAX9P55771 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAX9P55771 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PAX9P55771 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PAX9P55771 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PAX9P55771 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PAX9P55771 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PAX9P55771 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PAX9P55771 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PAX9P55771 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PAX9P55771 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PAX9P55771 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAX9P55771 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAX9P55771 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAX9P55771 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAX9P55771 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAX9P55771 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAX9P55771 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAX9P55771 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAX9P55771 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAX9P55771 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAX9P55771 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAX9P55771 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAX9P55771 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAX9P55771 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAX9P55771 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAX9P55771 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms