Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms