Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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