Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
C9orf92A6NGG3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms