Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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SNX13Q9Y5W8 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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SNX13Q9Y5W8 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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SNX13Q9Y5W8 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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