Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms