Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDZRN3Q9UPQ7 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDZRN3Q9UPQ7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDZRN3Q9UPQ7 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDZRN3Q9UPQ7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDZRN3Q9UPQ7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDZRN3Q9UPQ7 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDZRN3Q9UPQ7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PDZRN3Q9UPQ7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PDZRN3Q9UPQ7 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PDZRN3Q9UPQ7 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDZRN3Q9UPQ7 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDZRN3Q9UPQ7 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDZRN3Q9UPQ7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDZRN3Q9UPQ7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDZRN3Q9UPQ7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDZRN3Q9UPQ7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDZRN3Q9UPQ7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms