Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT23Q9C075 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms