Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOL4Q9BPW4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOL4Q9BPW4 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms