Protein–RNA interactions for Protein: Q99471

PFDN5, Prefoldin subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5Q99471 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PFDN5Q99471 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PFDN5Q99471 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PFDN5Q99471 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PFDN5Q99471 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PFDN5Q99471 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PFDN5Q99471 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PFDN5Q99471 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PFDN5Q99471 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PFDN5Q99471 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PFDN5Q99471 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PFDN5Q99471 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PFDN5Q99471 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PFDN5Q99471 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PFDN5Q99471 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PFDN5Q99471 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PFDN5Q99471 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PFDN5Q99471 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PFDN5Q99471 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PFDN5Q99471 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PFDN5Q99471 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PFDN5Q99471 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PFDN5Q99471 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PFDN5Q99471 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PFDN5Q99471 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PFDN5Q99471 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PFDN5Q99471 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PFDN5Q99471 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PFDN5Q99471 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms