Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
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PTPRNQ16849 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRNQ16849 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRNQ16849 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRNQ16849 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRNQ16849 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
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PTPRNQ16849 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRNQ16849 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
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PTPRNQ16849 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRNQ16849 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRNQ16849 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRNQ16849 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRNQ16849 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
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PTPRNQ16849 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
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PTPRNQ16849 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
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PTPRNQ16849 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
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PTPRNQ16849 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
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PTPRNQ16849 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
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PTPRNQ16849 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRNQ16849 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRNQ16849 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRNQ16849 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRNQ16849 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PTPRNQ16849 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRNQ16849 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRNQ16849 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRNQ16849 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
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