Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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BRD3Q15059 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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BRD3Q15059 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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BRD3Q15059 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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BRD3Q15059 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRD3Q15059 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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BRD3Q15059 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRD3Q15059 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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BRD3Q15059 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
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