Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CUL4BQ13620 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms