Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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