Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 ANKLE1-202ENST00000404085 3081 ntTSL 214.9□□□□□ -0.023e-6■■■■□ 20.1
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TARDBPQ13148 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.073e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 SUGP1-209ENST00000588731 2282 ntTSL 1 (best)14.6□□□□□ -0.073e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.083e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 AGAP3-221ENST00000490097 604 ntTSL 414.55□□□□□ -0.083e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.083e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 SEPT8-214ENST00000481794 694 ntTSL 214.51□□□□□ -0.093e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 CTSB-224ENST00000532392 570 ntTSL 414.36□□□□□ -0.113e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 CNOT8-207ENST00000518782 550 ntTSL 414.35□□□□□ -0.113e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.123e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.123e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.133e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.133e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.153e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 VEGFA-221ENST00000520265 336 ntTSL 514.12□□□□□ -0.153e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.163e-6■■■■□ 20.1
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TARDBPQ13148 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.173e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.193e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.23e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.23e-6■■■■□ 20.1
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TARDBPQ13148 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.233e-6■■■■□ 20.1
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TARDBPQ13148 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.283e-6■■■■□ 20.1
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TARDBPQ13148 PTPRF-202ENST00000372405 1962 ntTSL 1 (best)12.74□□□□□ -0.373e-6■■■■□ 20.1
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TARDBPQ13148 ADD1-207ENST00000446856 3745 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.383e-6■■■■□ 20.1
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TARDBPQ13148 VEGFA-210ENST00000457104 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.413e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 VEGFA-218ENST00000518689 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.413e-6■■■■□ 20.1
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TARDBPQ13148 VEGFA-223ENST00000523125 541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.413e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 COPS7B-209ENST00000412922 1935 ntTSL 512.48□□□□□ -0.413e-6■■■■□ 20.1
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TARDBPQ13148 SUGP1-201ENST00000247001 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.553e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 FAM173B-206ENST00000510052 534 ntTSL 511.52□□□□□ -0.573e-6■■■■□ 20.1
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TARDBPQ13148 ZNF326-201ENST00000340281 2729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.613e-6■■■■□ 20.1
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TARDBPQ13148 MROH1-208ENST00000532255 3905 ntTSL 211.22□□□□□ -0.613e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 MROH1-211ENST00000544576 3673 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.623e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 TMEM120B-207ENST00000541467 2959 ntTSL 511.19□□□□□ -0.623e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 FAM173B-207ENST00000511437 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.633e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 CYFIP1-205ENST00000612288 553 ntTSL 310.86□□□□□ -0.673e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 FAM173B-205ENST00000510047 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.73e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 IL10RB-206ENST00000609556 1341 ntTSL 510.68□□□□□ -0.73e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 ADD1-206ENST00000398129 3787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.713e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 COPZ1-216ENST00000552848 537 ntTSL 510.61□□□□□ -0.713e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 ZNF275-202ENST00000370251 6320 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.723e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 ADD1-210ENST00000503455 3206 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.723e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 COPZ1-202ENST00000455864 880 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.733e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 COPS7B-217ENST00000461350 3299 ntTSL 210.5□□□□□ -0.733e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 CLTCL1-209ENST00000617103 4859 ntTSL 1 (best)10.48□□□□□ -0.733e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 SLC39A8-204ENST00000502903 570 ntTSL 410.38□□□□□ -0.753e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 SEPT8-211ENST00000453480 773 ntTSL 510.17□□□□□ -0.783e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 ADD1-217ENST00000513328 3107 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.83e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 COPZ1-201ENST00000262061 1897 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.833e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 COPZ1-208ENST00000550027 553 ntTSL 1 (best)9.78□□□□□ -0.843e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 MLYCD-201ENST00000262430 13038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.855e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 CLTCL1-202ENST00000427926 5513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.863e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 IL10RB-204ENST00000493295 1991 ntTSL 29.62□□□□□ -0.873e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 CYFIP1-203ENST00000610365 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.873e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 CLTCL1-211ENST00000621271 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.893e-6■■■■□ 20.1
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