Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
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