Protein–RNA interactions for Protein: P47869

GABRA2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA2P47869 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA2P47869 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms