Protein–RNA interactions for Protein: Q9P016

THYN1, Thymocyte nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THYN1Q9P016 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
THYN1Q9P016 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
THYN1Q9P016 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
THYN1Q9P016 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
THYN1Q9P016 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
THYN1Q9P016 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
THYN1Q9P016 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
THYN1Q9P016 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
THYN1Q9P016 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
THYN1Q9P016 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
THYN1Q9P016 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
THYN1Q9P016 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
THYN1Q9P016 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
THYN1Q9P016 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.08■□□□□ 0
THYN1Q9P016 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
THYN1Q9P016 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.08■□□□□ 0
THYN1Q9P016 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
THYN1Q9P016 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
THYN1Q9P016 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
THYN1Q9P016 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
THYN1Q9P016 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
THYN1Q9P016 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms