Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMBRD1Q9NUN5 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms