Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SNTG1Q9NSN8 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNTG1Q9NSN8 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms