Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SORCS2Q96PQ0 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms