Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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