Protein–RNA interactions for Protein: Q14190

SIM2, Single-minded homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM2Q14190 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIM2Q14190 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIM2Q14190 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIM2Q14190 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIM2Q14190 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIM2Q14190 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIM2Q14190 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIM2Q14190 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIM2Q14190 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIM2Q14190 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIM2Q14190 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIM2Q14190 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIM2Q14190 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIM2Q14190 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIM2Q14190 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIM2Q14190 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIM2Q14190 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIM2Q14190 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIM2Q14190 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIM2Q14190 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIM2Q14190 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIM2Q14190 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIM2Q14190 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SIM2Q14190 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIM2Q14190 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIM2Q14190 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIM2Q14190 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIM2Q14190 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SIM2Q14190 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIM2Q14190 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SIM2Q14190 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIM2Q14190 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIM2Q14190 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIM2Q14190 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIM2Q14190 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIM2Q14190 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SIM2Q14190 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SIM2Q14190 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SIM2Q14190 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SIM2Q14190 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SIM2Q14190 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SIM2Q14190 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SIM2Q14190 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SIM2Q14190 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SIM2Q14190 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SIM2Q14190 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SIM2Q14190 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SIM2Q14190 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SIM2Q14190 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SIM2Q14190 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SIM2Q14190 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SIM2Q14190 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SIM2Q14190 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SIM2Q14190 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SIM2Q14190 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SIM2Q14190 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SIM2Q14190 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SIM2Q14190 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SIM2Q14190 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SIM2Q14190 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SIM2Q14190 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SIM2Q14190 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SIM2Q14190 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SIM2Q14190 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SIM2Q14190 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SIM2Q14190 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SIM2Q14190 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SIM2Q14190 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SIM2Q14190 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SIM2Q14190 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SIM2Q14190 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SIM2Q14190 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SIM2Q14190 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SIM2Q14190 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SIM2Q14190 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SIM2Q14190 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SIM2Q14190 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SIM2Q14190 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SIM2Q14190 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SIM2Q14190 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SIM2Q14190 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SIM2Q14190 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SIM2Q14190 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SIM2Q14190 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SIM2Q14190 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SIM2Q14190 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SIM2Q14190 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SIM2Q14190 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SIM2Q14190 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SIM2Q14190 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SIM2Q14190 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SIM2Q14190 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SIM2Q14190 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SIM2Q14190 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SIM2Q14190 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SIM2Q14190 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SIM2Q14190 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SIM2Q14190 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SIM2Q14190 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SIM2Q14190 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms