Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCN1BQ07699 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms