Protein–RNA interactions for Protein: P61009

SPCS3, Signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3P61009 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPCS3P61009 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPCS3P61009 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPCS3P61009 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPCS3P61009 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPCS3P61009 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPCS3P61009 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPCS3P61009 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPCS3P61009 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPCS3P61009 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPCS3P61009 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPCS3P61009 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPCS3P61009 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPCS3P61009 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPCS3P61009 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPCS3P61009 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPCS3P61009 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPCS3P61009 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPCS3P61009 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPCS3P61009 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPCS3P61009 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPCS3P61009 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPCS3P61009 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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