Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HTR2AP28223 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms