Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms