Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC3P02656 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC3P02656 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC3P02656 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC3P02656 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC3P02656 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC3P02656 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC3P02656 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC3P02656 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC3P02656 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC3P02656 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC3P02656 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC3P02656 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC3P02656 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC3P02656 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC3P02656 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC3P02656 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC3P02656 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC3P02656 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC3P02656 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC3P02656 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC3P02656 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC3P02656 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC3P02656 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC3P02656 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC3P02656 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC3P02656 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC3P02656 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC3P02656 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC3P02656 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC3P02656 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC3P02656 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC3P02656 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC3P02656 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC3P02656 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC3P02656 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC3P02656 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC3P02656 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC3P02656 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC3P02656 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC3P02656 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC3P02656 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC3P02656 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC3P02656 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC3P02656 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC3P02656 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC3P02656 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC3P02656 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC3P02656 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC3P02656 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC3P02656 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC3P02656 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC3P02656 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC3P02656 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC3P02656 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC3P02656 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC3P02656 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC3P02656 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC3P02656 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC3P02656 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC3P02656 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC3P02656 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC3P02656 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC3P02656 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC3P02656 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC3P02656 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC3P02656 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC3P02656 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC3P02656 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC3P02656 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC3P02656 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC3P02656 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC3P02656 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC3P02656 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC3P02656 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC3P02656 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC3P02656 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC3P02656 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC3P02656 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC3P02656 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC3P02656 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC3P02656 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC3P02656 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC3P02656 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC3P02656 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC3P02656 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC3P02656 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC3P02656 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC3P02656 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC3P02656 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC3P02656 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC3P02656 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC3P02656 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC3P02656 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC3P02656 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC3P02656 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC3P02656 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOC3P02656 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOC3P02656 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOC3P02656 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms