Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
NKX1-2Q9UD57 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKX1-2Q9UD57 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms