Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ19

ANKRD60, Ankyrin repeat domain-containing protein 60, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD60Q9BZ19 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD60Q9BZ19 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms