Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSNARE1Q96NA8 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms