Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 RSBN1L-203ENST00000445288 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.993e-9■■■■■ 34.8
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PRPF8Q6P2Q9 LSG1-203ENST00000437613 854 ntTSL 57.92□□□□□ -1.141e-8■■■■■ 34.8
PRPF8Q6P2Q9 LSG1-201ENST00000265245 3572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.161e-8■■■■■ 34.8
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PRPF8Q6P2Q9 FKBP5-202ENST00000536438 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.492e-9■■■■■ 34.8
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PRPF8Q6P2Q9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.282e-7■■■■■ 34.7
PRPF8Q6P2Q9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.213e-8■■■■■ 34.7
PRPF8Q6P2Q9 PPT2-EGFL8-204ENST00000453656 1327 ntTSL 214.76□□□□□ -0.053e-8■■■■■ 34.7
PRPF8Q6P2Q9 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.143e-8■■■■■ 34.7
PRPF8Q6P2Q9 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.183e-8■■■■■ 34.7
PRPF8Q6P2Q9 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.542e-7■■■■■ 34.7
PRPF8Q6P2Q9 BECN1-216ENST00000590852 570 ntTSL 25.42□□□□□ -1.544e-7■■■■■ 34.7
PRPF8Q6P2Q9 DDX5-225ENST00000583562 465 ntTSL 1 (best)4.8□□□□□ -1.641e-13■■■■■ 34.7
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PRPF8Q6P2Q9 HSD3B7-203ENST00000562932 746 ntTSL 513.51□□□□□ -0.253e-9■■■■■ 34.7
PRPF8Q6P2Q9 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.383e-9■■■■■ 34.7
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PRPF8Q6P2Q9 NUP58-214ENST00000495460 947 ntTSL 513.22□□□□□ -0.293e-9■■■■■ 34.7
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