Protein–RNA interactions for Protein: Q14677

CLINT1, Clathrin interactor 1, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLINT1Q14677 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLINT1Q14677 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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