Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TARDBPQ13148 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.792e-6■■■■□ 20.3
TARDBPQ13148 ANAPC4-210ENST00000510092 2599 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.682e-6■■■■□ 20.3
TARDBPQ13148 CENPJ-201ENST00000381884 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.332e-6■■■■□ 20.3
TARDBPQ13148 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.382e-6■■■■□ 20.3
TARDBPQ13148 CENPJ-202ENST00000418179 691 ntTSL 1 (best)6.16□□□□□ -1.422e-6■■■■□ 20.3
TARDBPQ13148 ANAPC4-211ENST00000515848 2089 ntTSL 25.09□□□□□ -1.592e-6■■■■□ 20.3
TARDBPQ13148 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.82e-6■■■■□ 20.3
TARDBPQ13148 ANAPC4-203ENST00000504256 3807 ntTSL 1 (best)2.51□□□□□ -2.012e-6■■■■□ 20.3
TARDBPQ13148 XPO1-212ENST00000457483 488 ntTSL 46.95□□□□□ -1.34e-21■■■■□ 20.2
TARDBPQ13148 XPO1-210ENST00000449444 579 ntTSL 43.88□□□□□ -1.794e-21■■■■□ 20.2
TARDBPQ13148 XPO1-220ENST00000481214 720 ntTSL 23.63□□□□□ -1.834e-21■■■■□ 20.2
TARDBPQ13148 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.019e-8■■■■□ 20.2
TARDBPQ13148 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.572e-6■■■■□ 20.2
TARDBPQ13148 PPP1R12A-201ENST00000261207 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.381e-7■■■■□ 20.2
TARDBPQ13148 PPP1R12A-203ENST00000450142 5721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.61e-7■■■■□ 20.2
TARDBPQ13148 SMYD3-201ENST00000366516 1863 ntTSL 1 (best)8.78□□□□□ -13e-7■■■■□ 20.2
TARDBPQ13148 SMYD3-202ENST00000366517 1372 ntTSL 1 (best)7.71□□□□□ -1.173e-7■■■■□ 20.2
TARDBPQ13148 SMYD3-209ENST00000470510 1042 ntTSL 57.33□□□□□ -1.243e-7■■■■□ 20.2
TARDBPQ13148 PCSK9-201ENST00000302118 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.546e-7■■■■□ 20.2
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