Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERVK_113P61574 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms