Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CLK1P49759 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CLK1P49759 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CLK1P49759 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLK1P49759 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CLK1P49759 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLK1P49759 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLK1P49759 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLK1P49759 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLK1P49759 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLK1P49759 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLK1P49759 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLK1P49759 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLK1P49759 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLK1P49759 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLK1P49759 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLK1P49759 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CLK1P49759 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLK1P49759 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLK1P49759 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLK1P49759 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CLK1P49759 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLK1P49759 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLK1P49759 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CLK1P49759 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLK1P49759 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLK1P49759 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLK1P49759 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLK1P49759 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLK1P49759 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLK1P49759 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLK1P49759 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLK1P49759 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLK1P49759 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLK1P49759 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLK1P49759 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLK1P49759 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLK1P49759 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLK1P49759 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLK1P49759 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLK1P49759 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLK1P49759 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLK1P49759 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLK1P49759 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLK1P49759 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLK1P49759 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLK1P49759 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLK1P49759 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CLK1P49759 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLK1P49759 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLK1P49759 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLK1P49759 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLK1P49759 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLK1P49759 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLK1P49759 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLK1P49759 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLK1P49759 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLK1P49759 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLK1P49759 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CLK1P49759 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLK1P49759 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLK1P49759 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLK1P49759 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLK1P49759 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLK1P49759 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLK1P49759 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLK1P49759 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLK1P49759 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLK1P49759 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLK1P49759 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLK1P49759 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLK1P49759 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLK1P49759 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLK1P49759 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLK1P49759 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLK1P49759 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLK1P49759 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLK1P49759 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CLK1P49759 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLK1P49759 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLK1P49759 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLK1P49759 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLK1P49759 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLK1P49759 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLK1P49759 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLK1P49759 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLK1P49759 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLK1P49759 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLK1P49759 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLK1P49759 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLK1P49759 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLK1P49759 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLK1P49759 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLK1P49759 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLK1P49759 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLK1P49759 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLK1P49759 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLK1P49759 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLK1P49759 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLK1P49759 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms