Protein–RNA interactions for Protein: P24522

GADD45A, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45AP24522 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GADD45AP24522 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GADD45AP24522 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GADD45AP24522 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GADD45AP24522 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GADD45AP24522 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GADD45AP24522 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GADD45AP24522 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GADD45AP24522 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GADD45AP24522 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GADD45AP24522 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GADD45AP24522 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GADD45AP24522 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GADD45AP24522 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GADD45AP24522 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GADD45AP24522 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GADD45AP24522 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GADD45AP24522 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GADD45AP24522 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GADD45AP24522 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GADD45AP24522 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GADD45AP24522 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GADD45AP24522 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GADD45AP24522 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GADD45AP24522 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GADD45AP24522 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GADD45AP24522 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GADD45AP24522 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GADD45AP24522 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GADD45AP24522 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GADD45AP24522 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GADD45AP24522 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GADD45AP24522 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GADD45AP24522 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GADD45AP24522 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GADD45AP24522 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GADD45AP24522 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GADD45AP24522 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GADD45AP24522 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GADD45AP24522 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GADD45AP24522 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GADD45AP24522 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GADD45AP24522 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GADD45AP24522 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GADD45AP24522 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GADD45AP24522 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GADD45AP24522 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GADD45AP24522 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GADD45AP24522 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GADD45AP24522 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GADD45AP24522 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GADD45AP24522 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GADD45AP24522 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GADD45AP24522 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GADD45AP24522 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GADD45AP24522 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GADD45AP24522 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GADD45AP24522 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GADD45AP24522 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GADD45AP24522 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GADD45AP24522 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GADD45AP24522 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GADD45AP24522 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GADD45AP24522 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GADD45AP24522 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GADD45AP24522 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GADD45AP24522 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GADD45AP24522 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GADD45AP24522 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GADD45AP24522 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GADD45AP24522 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GADD45AP24522 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GADD45AP24522 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GADD45AP24522 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GADD45AP24522 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GADD45AP24522 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GADD45AP24522 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GADD45AP24522 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GADD45AP24522 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GADD45AP24522 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GADD45AP24522 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GADD45AP24522 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GADD45AP24522 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GADD45AP24522 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GADD45AP24522 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GADD45AP24522 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GADD45AP24522 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GADD45AP24522 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GADD45AP24522 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GADD45AP24522 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GADD45AP24522 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GADD45AP24522 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GADD45AP24522 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GADD45AP24522 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GADD45AP24522 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GADD45AP24522 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GADD45AP24522 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GADD45AP24522 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GADD45AP24522 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GADD45AP24522 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms