Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP4AP20648 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms