Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms