Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREB1P16220 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREB1P16220 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CREB1P16220 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CREB1P16220 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CREB1P16220 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CREB1P16220 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CREB1P16220 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CREB1P16220 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CREB1P16220 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CREB1P16220 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CREB1P16220 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CREB1P16220 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CREB1P16220 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CREB1P16220 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CREB1P16220 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CREB1P16220 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CREB1P16220 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CREB1P16220 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CREB1P16220 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CREB1P16220 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CREB1P16220 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CREB1P16220 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CREB1P16220 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CREB1P16220 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CREB1P16220 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CREB1P16220 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CREB1P16220 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CREB1P16220 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CREB1P16220 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CREB1P16220 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CREB1P16220 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CREB1P16220 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CREB1P16220 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CREB1P16220 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CREB1P16220 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CREB1P16220 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CREB1P16220 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CREB1P16220 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CREB1P16220 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CREB1P16220 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CREB1P16220 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CREB1P16220 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CREB1P16220 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CREB1P16220 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CREB1P16220 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CREB1P16220 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CREB1P16220 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CREB1P16220 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CREB1P16220 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CREB1P16220 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CREB1P16220 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CREB1P16220 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CREB1P16220 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CREB1P16220 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CREB1P16220 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CREB1P16220 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CREB1P16220 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CREB1P16220 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CREB1P16220 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CREB1P16220 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CREB1P16220 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CREB1P16220 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CREB1P16220 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CREB1P16220 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CREB1P16220 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CREB1P16220 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CREB1P16220 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CREB1P16220 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CREB1P16220 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CREB1P16220 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CREB1P16220 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CREB1P16220 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CREB1P16220 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CREB1P16220 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CREB1P16220 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CREB1P16220 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CREB1P16220 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CREB1P16220 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CREB1P16220 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CREB1P16220 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CREB1P16220 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CREB1P16220 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CREB1P16220 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CREB1P16220 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CREB1P16220 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CREB1P16220 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CREB1P16220 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CREB1P16220 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CREB1P16220 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CREB1P16220 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CREB1P16220 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CREB1P16220 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CREB1P16220 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CREB1P16220 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CREB1P16220 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CREB1P16220 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CREB1P16220 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CREB1P16220 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CREB1P16220 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms