Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTN4O43707 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTN4O43707 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTN4O43707 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTN4O43707 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTN4O43707 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN4O43707 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN4O43707 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN4O43707 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN4O43707 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN4O43707 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN4O43707 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN4O43707 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN4O43707 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN4O43707 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN4O43707 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN4O43707 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN4O43707 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN4O43707 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN4O43707 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN4O43707 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN4O43707 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN4O43707 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN4O43707 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN4O43707 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN4O43707 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN4O43707 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN4O43707 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN4O43707 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN4O43707 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN4O43707 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN4O43707 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN4O43707 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN4O43707 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN4O43707 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN4O43707 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN4O43707 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN4O43707 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN4O43707 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN4O43707 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN4O43707 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN4O43707 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN4O43707 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN4O43707 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN4O43707 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN4O43707 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN4O43707 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN4O43707 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN4O43707 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN4O43707 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN4O43707 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN4O43707 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN4O43707 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN4O43707 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACTN4O43707 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACTN4O43707 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACTN4O43707 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACTN4O43707 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACTN4O43707 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACTN4O43707 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACTN4O43707 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTN4O43707 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTN4O43707 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTN4O43707 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTN4O43707 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTN4O43707 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTN4O43707 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTN4O43707 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTN4O43707 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTN4O43707 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTN4O43707 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTN4O43707 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTN4O43707 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTN4O43707 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTN4O43707 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTN4O43707 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTN4O43707 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTN4O43707 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTN4O43707 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTN4O43707 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTN4O43707 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTN4O43707 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTN4O43707 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTN4O43707 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTN4O43707 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTN4O43707 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTN4O43707 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTN4O43707 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTN4O43707 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTN4O43707 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTN4O43707 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTN4O43707 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTN4O43707 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTN4O43707 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTN4O43707 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTN4O43707 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTN4O43707 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTN4O43707 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTN4O43707 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTN4O43707 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms