Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L9A6NEM1 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms