Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ5

KRTAP4-6, Keratin-associated protein 4-6, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-6Q9BYQ5 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 PTPRA-203ENST00000356147 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 ABCF1-202ENST00000376545 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 LINC00484-205ENST00000423719 3023 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 FN1-203ENST00000354785 8905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 MADD-210ENST00000407859 5744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 KANK1-206ENST00000382303 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 PDE7B-201ENST00000308191 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 SALL1-201ENST00000251020 5146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 LY9-201ENST00000263285 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 C5orf56-201ENST00000337752 4767 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 RP1-201ENST00000220676 7100 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 LCA5-201ENST00000369846 4542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 COL12A1-203ENST00000416123 8964 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 HPCAL4-202ENST00000612703 4436 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 LRRC32-203ENST00000407242 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 POLR1A-203ENST00000409681 6454 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 MSC-AS1-201ENST00000457356 4220 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 NTPCR-202ENST00000366628 6311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 WDR47-205ENST00000400794 4134 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 MTMR3-201ENST00000323630 5866 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 ADGRG1-255ENST00000567835 3741 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 SS18-203ENST00000415083 3414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 ARHGAP12-204ENST00000375250 4914 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 SLC13A3-210ENST00000472148 3283 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 MEIS2-222ENST00000561208 4822 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 ABL2-206ENST00000504405 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 NLGN4X-208ENST00000538097 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 GRIA1-213ENST00000521843 3069 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 NLRP8-202ENST00000590542 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 KRIT1-201ENST00000340022 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 ADA2-203ENST00000399837 4505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 CYFIP1-203ENST00000610365 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 TRIM16-201ENST00000336708 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 CCDC144A-206ENST00000399273 8686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 SLC28A1-203ENST00000394573 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 STXBP5L-201ENST00000273666 9496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 C14orf159-217ENST00000520328 2687 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 RSU1-203ENST00000377921 3919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 GRM8-203ENST00000358373 3850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 RNA5SP448-201ENST00000363151 111 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 MICG-208ENST00000416822 132 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 AL139327.3-201ENST00000433721 379 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 AC124067.1-201ENST00000517897 169 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 AL049869.4-201ENST00000555669 178 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 MIR5192-201ENST00000579892 92 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 AC016876.3-201ENST00000610459 426 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 MIR6745-201ENST00000612694 127 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 FKBP1AP4-201ENST00000631775 336 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 AC087762.2-201ENST00000639346 3773 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 SNCAIP-201ENST00000261367 4986 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 ZNF608-201ENST00000306315 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 N6AMT1-202ENST00000351429 4781 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 MMS19-202ENST00000355839 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 NFATC2IP-203ENST00000564978 2350 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 AP002748.4-201ENST00000419755 3547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 TMC3-201ENST00000359440 4641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 TMF1-201ENST00000398559 6849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 FGD3-201ENST00000337352 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 SIDT2-202ENST00000324225 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 MICAL2-203ENST00000379612 6625 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 SORBS2-230ENST00000448662 4356 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 BEST1-202ENST00000449131 4267 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 DNM1P35-201ENST00000501931 3188 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 MED23-205ENST00000368068 5233 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 PHF19-214ENST00000616568 4159 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 RAD54L-201ENST00000371975 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 UPF2-202ENST00000357604 5193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 NUMB-223ENST00000556772 5172 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 ARHGEF15-202ENST00000421050 4138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 TTC39C-203ENST00000540918 4117 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 LRRC2-202ENST00000395905 5100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 SEZ6L-205ENST00000403121 3078 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 AKAP1-208ENST00000572557 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 LINC00654-201ENST00000379053 6113 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 OR4D9-203ENST00000641962 6123 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 ZNF181-204ENST00000492450 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 SYNJ2-204ENST00000367122 3029 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-6Q9BYQ5 RAD51D-202ENST00000345365 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.1 ms