Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms