Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms